自然科學探究式教學除了根基於認知取向的學習效能，同時為學習者帶來科學本質認知與科學過程技能的增進。D. L. Schwartz於2004年的研究發現，行為學派直接教學法與認知學派探究式教學，在物理課堂中需要進行調和，能夠達到較好的教學效果。所以並不是所有內容都拿來做探究式教學設計，課堂就能夠順利進行。
我們看到馬路旁抓違規的交通警察，一般第一個動作都是先請對方拿出駕照。但是，如果依據科學本質，回應探究能力的科學素養，將整個過程當作科學研究，警察應該第一步先確認對方是否為生物，接著判斷是否為人類，是否屬於臺灣人，接著才要求對方提供駕照。然而，從知識管理(knowledge management)的角度看起來，可靠的經驗仍然可以成為知識，依據交通警察的經驗，身體外型與交警類似，有軀幹、四肢、頭部，一般都是人類，同時黃皮膚又氣質相近的可以猜測為臺灣人，甚至某些騎乘姿勢還可以判斷細分，所以一般不需要從確認是否具有生命跡象開始研究、確認。
回來看待探究式課程也是如此，考慮到教學效能，教師可以先利用直接教學法鋪陳知識鷹架或情境設計，不需要從頭到尾每個細節都拿出來進行探究。
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